Markus Beckedahl ist Gründer von netzpolitik.org, einem Medium für digitale Freiheitsrechte, einem der größten gemeinwohlorientierten Medien in Deutschland. Bis Anfang 2022 war er dort Chefredakteur. Er ist Mitgründer der re:publica-Konferenz, Europas führender „Internet und Gesellschaft“-Konferenz und kuratiert seit den Anfängen 2007 das Programm mit. 
Zwischen 2010-2013 Sachverständiger in der Enquete-Kommission des Deutschen Bundestages zu “Internet und digitale Gesellschaft”, seit 2010 Mitglied des Medienrates der Medienanstalt Berlin-Brandenburg. 2012 veröffentlichte Beckedahl mit Falk Lüke: Die Digitale Gesellschaft – Netzpolitik, Bürgerrechte und die Machtfrage (Berlin, dtv), 2013 als Hg mit Andre Meister:  Überwachtes Netz: Edward Snowden und der größte Überwachungsskandal der Geschichte (Berlin, newthink communications).
Auszeichnungen: u.a. Für seine Arbeit mit netzpolitik.org den Grimme Online Award in der Kategorie Spezial und den Günther-Wallraff-Preis für Journalismuskritik erhalten, „Team des Jahres“ bei den Journalisten des Jahres 2015 des Medium-Magazins.