Nach Studium und Promotion im Fach Bioinformatik sowie erster Dozentur an der Universität Tübingen leitet Alexander Herbig seit 2015 die Forschungsgruppe für Pathogenom-Bioinformatik als Teil der Abteilung für Archäogenetik, die am Max-Planck-Institut für Evolutionäre Anthropologie in Leipzig angesiedelt ist.

Der Fokus der Arbeitsgruppe liegt hauptsächlich auf der Erforschung der Evolution verschiedener menschlicher Krankheitserreger wie beispielsweise der Pest, deren Erbgut sich aus archäologischen Funden isolieren lässt. Ein weiterer Fokus liegt auf der Entwicklung von Methoden zur Detektion und Rekonstruktion entsprechenden Erbguts sowie zur vergleichenden Analyse.